PANDA是一个基于Matlab的分析DWI数据的工具包，可以对DTI指标进行基于ROI和TBSS分析，以及进行基于确定性或概率性纤维追踪的结构连接分析。
作者：Alex
使用FIRST分析皮下核团形变
介绍使用FSL的FIRST分析皮下核团形变的方法。
使用SPM12进行VBM分析
介绍使用SPM12进行基于体素的形态学分析(VBM)的步骤。
使用SUIT分析小脑数据
使用SUIT进行小脑的形态学分析(灰质体积)的基本方法。
使用DPABI进行统计分析
总结使用DPABI的统计模块对MRI图像进行统计分析的基本方法，并与SPM的统计结果进行简单对比。
使用DPARSF处理静息态fMRI数据
DPARSF是一个基于SPM的静息态fMRI数据处理软件，提供了流行的静息态 fMRI 数据处理方案。DPARSF在其官网上有视频教程，这里是我自己的学习总结，理解不一定准确。
使用BrainNet Viewer进行可视化
BrainNet Viewer是一个基于MATLAB的可视化工具，适合于展示基于图论的脑网络分析结果。
文献阅读:去除funtional connectivity MRI中的头动噪声
自从Power et al. (2012)等研究表明头动对于估计功能连接的负面影响后，关于头动噪声的处理可能是fMRI数据分析中审稿人最为关注的一部分，特别是在发展和临床研究中。这里分享一篇2018年发表在Nature Protocols上的文章，该文章提出了一个去除functional connectivity MRI中头动噪声的最佳方案。