老师您好,我在第一步segmentation&isolation报错:
Undefined function ‘vararginoptions’ for input arguments of type ‘cell’.
In file “D:\matlab2013b\toolbox\spm12\toolbox\suit\suit_isolate_seg.m” (???), function “suit_isolate_seg” at line 84.
In file “D:\matlab2013b\toolbox\spm12\toolbox\suit\suit_isolate_seg.m” (???), function “suit_isolate_seg” at line 202.
您知道是什么原因吗?
好的,我在按您的教程运行的时候,报错如下,我该怎么解决呢
u_a_rrHC003_seg1: atemp_rrHC003_seg1 1,1,1
17-Apr-2024 21:33:02 – Failed ‘Reslice into SUIT space using Dartel flowfield’
无法执行赋值,因为左侧的大小为 71×48,右侧的大小为 141×95。
In file “/FileSys/shilinfeng/spm12/toolbox/suit/suit_reslice_dartel.m” (???), function “suit_reslice_dartel” at line 115.
The following modules did not run:
Failed: Reslice into SUIT space using Dartel flowfield
老师 可以分享一下这个SUIT工具包吗 官网下载下来被破坏了 感恩感谢了
已发到你邮箱。
老师,怎么调图像朝向为LPI呀?
PDF里不是有写吗?
老师您好,我在第一步segmentation&isolation报错:
Undefined function ‘vararginoptions’ for input arguments of type ‘cell’.
In file “D:\matlab2013b\toolbox\spm12\toolbox\suit\suit_isolate_seg.m” (???), function “suit_isolate_seg” at line 84.
In file “D:\matlab2013b\toolbox\spm12\toolbox\suit\suit_isolate_seg.m” (???), function “suit_isolate_seg” at line 202.
您知道是什么原因吗?
我也不清楚,会不会是suit本身的bug?
老师,您好,我看在每一步预处理的过程中,每一名被试的结果都要分开输进去,如果有上百例被试的话,在数据重采样到 SUIT 模板空间这一步的时候,要点上千次,太麻烦了,请问老师有批处理的代码吗
确实很麻烦,不过我并没有批处理代码,因为我自己对suit了解也很少,不过我记得suit官方教程上是有介绍具体调用的函数,你可以参考一下函数用法。
老师,您好。我按照您给的教程做完小脑预处理之后,接下来要提取小脑分区的灰质体积值,先在suit目录下新建文件夹atlas,将Cerebellum-SUIT.nii放进去,然后选择该模板,运行,一直报下面的错误:
12-Aug-2022 09:51:05 – Failed ‘Summarize statistics by lobules’
错误使用 vararginoptions (line 44)
unknown option:regionname
这是模板有问题吗?可不可以将教程里用的模板分享给我?
也许是suit版本的问题,我很久没用过这个工具包,我把我以前用的版本发给你试试。注意查收邮箱。
我也遇到了相似的问题,可不可以再分享一次您使用的版本啊。谢谢您。
老师,您好。我按照您给的教程做完小脑预处理之后,接下来要提取小脑分区的灰质体积值,先在suit目录下新建文件夹atlas,将Cerebellum-SUIT.nii放进去,然后选择该模板,运行,一直报下面的错误:
12-Aug-2022 09:51:05 – Failed ‘Summarize statistics by lobules’
错误使用 vararginoptions (line 44)
unknown option:regionname
这是模板有问题吗?可不可以将教程里用的模板分享给我
我使用的suit版本已发送到你的邮箱。
我也遇到了同样的问题,不知道您是怎么解决的?
Failed ‘Summarize statistics by lobules’
老师,您好!我下载了suit-3.5版本,放入spm12的toolbox之后,在matlab里打开spm,toolbox界面没有显示SUIT,请问这是什么原因,如何解决这个问题?谢谢您!
我不太清楚,你的suit文件夹的名字是suit吗?是不是还有其他字符?
老师您好!我下载工具包并解压之后是suit-3.5
那你将文件夹名字改为suit试试
请问您解决了吗?我也遇到了一样的问题
求分享SUIT工具包,官网下载不下来
我把suit包上传到百度网盘了:链接:https://pan.baidu.com/s/1kaNCv6uB5OfX2sKrDKdxaA 密码:35dh
注意我分享的是我文档里使用的版本。新版本的我也没用过。
老师您好,请问您计算ROI分区体积用的是“Lobule-SUIT.nii”模板,还是“Cerebellum-SUIT.nii”模板,如果是前者的话,可以分享一下该模板吗?我在网上各处都没有找到这个模板了。
我很久没用过SUIT这个包了,从PDF文档里看来,用的是Cerebellum-SUIT.nii。
另外,我更倾向于用CAT12来做,因为比较新的CAT12包里也有SUIT的小脑分区。我并不觉得SUIT包的小脑分析更准确。
老师,请问您计算ROI分区体积,最后得到的nanmean值表示的是灰质体积比例,请问这个比例谁比谁的比例呢
这个比例指的是一个体素的灰质比例,比如,0.5表示一个体素中有50%是灰质。根据体素大小和脑区体素个数,也可以把这个灰质比例换算成绝对体积(mm^3)。
老师,如果想获取脑区的灰质体积是不是用nanmean这个比列乘以s脑区size就可以得到这个脑区的灰质体积了?
是的,得到以mm^3为单位的体积。
老师您好,请问在Reslice的步骤可以应用到fMRI数据上吗?
我觉得应该可以,只要你的fMRI数据已经对齐到T1数据上了,因为suit本身是基于SPM,所以我觉得操作应该是相似的。不过我并没有测试过。
解压后,将suit⽂件夹放在SPM12的toolbox⽬录下了,但是打开SPM后,在SPM的toolbox下选择看不到suit?请问这是什么原因,下载的suit-3.5版本
你的suit文件夹下直接是代码,还是有子文件夹?
请问老师,我在完成图像预处理之后,对图像分割怎么可以批处理,我放了多个被试结果,他只运行了第一个,请问怎么处理呢
也许只能使用脚本来实现多被试的分析。我写了一个简单的教程,介绍如何通过脚本使用SPM的分析模块:https://act-ask.cn/forum.php?mod=viewthread&tid=193&extra=page%3D1
如果你对Matlab代码有基本的了解,应该就没啥问题。
好的,我在按您的教程运行的时候,报错如下,我该怎么解决呢
u_a_rrHC003_seg1: atemp_rrHC003_seg1 1,1,1
17-Apr-2024 21:33:02 – Failed ‘Reslice into SUIT space using Dartel flowfield’
无法执行赋值,因为左侧的大小为 71×48,右侧的大小为 141×95。
In file “/FileSys/shilinfeng/spm12/toolbox/suit/suit_reslice_dartel.m” (???), function “suit_reslice_dartel” at line 115.
The following modules did not run:
Failed: Reslice into SUIT space using Dartel flowfield
你这个是用图形界面做的分析,还是代码?光从报错信息,我也无法判断是什么问题。
我一般在学习一个新软件的时候,会先跑一个被试,把整个流程跑通,确保操作上没问题。如果跑一个被试没问题,但是多被试有问题,也可能是某些被试数据不太一样。