使用SDM-PSI进行基于坐标的元分析

介绍使用SDM-PSI(Seed-based d Mapping with Permutation of Subject Images)进行基于坐标的元分析(coordinate-based meta analysis)的基本步骤。

《使用SDM-PSI进行基于坐标的元分析》有14条评论

  1. 您好,我最近刚接触SDM-PSI,今天打开后刚刚点击change-Meta analysis想要选择自己的数据文件夹,但是程序自动关闭并且再次双击打开时无法运行,重新下载后也打不开程序了,请问有什么解决方法吗?谢谢!!

    1. 我也出现过这种情况,我的解决方案是把电脑里所有SDM的文件都删除了,包括他生成的文件,再删除了他的注册表,之后重新下载,现在正常使用了,希望能帮到你。

      1. 老师您好请问,这种删除方法会误伤其他软件吗?还是说SDM文件是这个软件独有的呢?注册表是指哪个?我之前也是遇到这个问题,试了好几台电脑都不行,就用AES—SDM做了。

        1. 我删到之后并没有造成其他软件不能使用的情况。注册表就是window+R 输入regedit,然后搜索一下SDM。

  2. 您好,我想问一下用SdmPsiGui进行TBSS分析的话,需要在预处理之前进行的操作,是需要原始研究的t统计图像才可以是吗?

    1. 我没有做过TBSS的元分析,不过我去看了一下官方的文档,我的理解是,如果你有TBSS研究的原始统计图,那么对原始统计图的处理方式和通常的元分析不一样;如果你没有原始统计图,那就和通常的元分析是一样的。

      1. 非常感谢您的回复,对我的帮助很大。想再次请教您该软件是否可以进行敏感性分析,如果可以的话是每次去掉1个研究自己再重新运行一遍数据吗?非常期待您的再次回复。

        1. 我记得好像以前的SDM是可以做敏感性分析的,在SDM-PSI里好像没有敏感性分析的选项了,我猜测是因为SDM-PSI需要重建被试数据从而进行置换检验,计算时间太长了。当然你可以手动逐一去除研究然后重复分析,但是比较麻烦。

          1. 您好,我现在也涉及到要进行敏感性分析的问题,请问这个是必须进行的一步吗,如果SDM-PSI没有办法进行的话是否有别的程序可以进行敏感性分析呢。还想要请教您的一个问题是SDM-PSI运行Bias test后发现Metabias test的p值是0.006,Excess Significance test的p值是0.964,这是否表明存在发表偏倚呢,如果存在的话要如何处理,非常感谢

            1. (1)我也不清楚是否还有其他方法可以进行敏感性分析;(2)我感觉你的结果表明存在publication bias,不过我很久没做过元分析了,而且这部分内容SDM-PSI文档介绍得不是很多,所以我并不十分确定。如果确实存在publication bias,要怎么校正我也不清楚。不过我印象中,这些分析是针对每一个cluster单独进行的,一个cluster有bias,不表示其他cluster也有。所以我觉得这是影像元分析和一般的元分析不一样的地方。(3)我的建议是,一方面可以去SDM的官方论坛问一问,这个应该是最权威的信息来源;另一方面可以参考使用SDM-PSI发表的文献或者使用其他软件做的影像元分析的文献,如果大多数文献都没有做这些,我感觉就不必太纠结这部分分析的结果。

  3. 您好,我想请教一下。我做完jackknife sensitivity analysis后,得到的数据结果并不稳定。是哪里出问题了吗?

    1. jackknife sensitivity analysis应该就是每次去掉一个研究,然后重复分析吧?可能是某一个或一些研究的结果和其他研究的结果明显不同,影响了结果的稳定性。不过我对元分析了解很浅,建议咨询这方面更专业的老师。

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