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分类: MRI

使用Melodic进行独立成分分析

作者 Alex发布于 2017-09-212023-05-19分类 MRI标签 dual regression、FSL、ICA于使用Melodic进行独立成分分析留下评论

独立成分分析(ICA)是一种常用的脑网络分析方法。这里简单介绍如何使用Melodic进行单被试和多被试(结合双回归)独立成分分析,以及如何查看ICA的结果。

使用ANTs进行MRI图像配准

作者 Alex发布于 2017-09-202023-05-12分类 MRI标签 normalization、registration、standard space使用ANTs进行MRI图像配准有3条评论

除了原始数据本身的质量,配准大概是fMRI预处理中最影响数据质量的步骤吧。这里主要介绍如何使用ANTs(Advanced Normalization Tools)进行结构像和功能像的配准,也包括如何安装ANTs和检查配准效果。

使用BET对结构像进行颅骨剥离

作者 Alex发布于 2017-09-192023-05-10分类 MRI标签 brain extraction、FSL、structural MRI于使用BET对结构像进行颅骨剥离留下评论

颅骨剥离是fMRI数据分析中常见的步骤,这里介绍了结构像和功能像的区别、颅骨剥离的作用、使用Bet命令进行颅骨剥离以及如何检查颅骨剥离的效果。

使用dcm2nii将dcm文件转换为nii格式

作者 Alex发布于 2017-09-192023-05-06分类 MRI标签 dicom、MRIcron、nifti于使用dcm2nii将dcm文件转换为nii格式留下评论

fMRI数据分析的第一步往往是将格式为dcm或IMA的原始数据转换成nii或nii.gz的格式。这里介绍如何使用MRIcron里的dcm2nii命令将dcm文件转换成nii格式,也包括如何安装MRIcron。

Ubuntu下安装AFNI和FSL

作者 Alex发布于 2017-09-182023-05-05分类 MRI标签 AFNI、fMRI、FSL于Ubuntu下安装AFNI和FSL留下评论

AFNI和FSL是两款比较常用的fMRI数据分析软件,这里介绍一下如何在Ubuntu系统下安装AFNI和FSL,完全按照软件官网教程的步骤来安装,尽可能确保正确的安装了最新版的软件。

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