独立成分分析（ICA）是一种常用的脑网络分析方法。这里简单介绍如何使用Melodic进行单被试和多被试（结合双回归）独立成分分析，以及如何查看ICA的结果。
使用ANTs进行MRI图像配准
除了原始数据本身的质量，配准大概是fMRI预处理中最影响数据质量的步骤吧。这里主要介绍如何使用ANTs（Advanced Normalization Tools）进行结构像和功能像的配准，也包括如何安装ANTs和检查配准效果。
使用BET对结构像进行颅骨剥离
颅骨剥离是fMRI数据分析中常见的步骤，这里介绍了结构像和功能像的区别、颅骨剥离的作用、使用Bet命令进行颅骨剥离以及如何检查颅骨剥离的效果。
使用dcm2nii将dcm文件转换为nii格式
fMRI数据分析的第一步往往是将格式为dcm或IMA的原始数据转换成nii或nii.gz的格式。这里介绍如何使用MRIcron里的dcm2nii命令将dcm文件转换成nii格式，也包括如何安装MRIcron。
Ubuntu下安装AFNI和FSL
AFNI和FSL是两款比较常用的fMRI数据分析软件，这里介绍一下如何在Ubuntu系统下安装AFNI和FSL，完全按照软件官网教程的步骤来安装，尽可能确保正确的安装了最新版的软件。
Linux下使用Vim编辑Shell脚本
在fMRI数据处理中，常需要编辑脚本。Vim是一款常用的文本编辑器，特别是需要远程登录服务器处理数据的时候。这里介绍Vim编辑器的基本用法，包括新建、编辑、保存、退出脚本以及查找功能等。
Linux命令行简介
学习一些 Linux 命令行的基本知识对于安装和使用fMRI数据分析软件是必须的。这里介绍关于命令行的4个重要的概念，即什么是命令行、命令、路径变量和SHELL。
如何为VirtualBox虚拟机设置共享文件夹
在VirtualBox虚拟机中安装了新的操作系统后，往往需要设置共享文件夹，以实现不同系统中的数据共享。这里介绍主机系统是Mac OS，客机系统是Ubuntu的情况下添加共享文件夹的方法。